- เทคนิคทางวิทยาศาสตร์ที่ได้รับการปรับปรุงทำให้นักวิจัยเข้าใจถึงวิธีการทำงานของจีโนมมนุษย์มากขึ้น
- จากการดูจีโนมและอีพีจีโนมของเนื้องอกมะเร็งสมอง นักวิจัยสามารถคาดการณ์ผลลัพธ์ของผู้ป่วยได้แล้ว
- ข้อมูลนี้ยังสามารถใช้เพื่อระบุวิธีการรักษาที่จะเป็นประโยชน์มากที่สุดในการรักษามะเร็งบางชนิด
- จากผลการวิจัย นักวิทยาศาสตร์ได้ทดสอบยา abemaciclib สำหรับมะเร็งเต้านมในผู้ป่วยจำนวนน้อย และพบว่าอาการดีขึ้นและขนาดของเนื้องอกลดลงการทดลองทางคลินิกในอนาคตหวังว่าจะตรวจสอบการค้นพบในระยะแรกเหล่านี้
การจัดลำดับจีโนมของเนื้องอกมะเร็งมักใช้เพื่อช่วยในการระบุชนิดของมะเร็งที่บุคคลมีและวิธีการรักษาที่ดีที่สุด
แม้ว่าจีโนมของมะเร็งจะถูกนำมาใช้มาสองสามปีแล้ว แต่นักวิทยาศาสตร์ยังคงเรียนรู้เกี่ยวกับวิธีที่ดีที่สุดในการใช้ข้อมูลจีโนมในการให้คะแนนและจัดประเภทมะเร็ง
พื้นที่หนึ่งที่ได้รับความสนใจเพียงเล็กน้อยจนถึงขณะนี้คือสถานะเมทิลเลชันของจีโนมมะเร็งรอบๆ ยีนที่เฉพาะเจาะจง
ระดับการแสดงออกของยีนบางชนิดอาจได้รับผลกระทบจากตัวแปรจำนวนสำเนา (CNV) CNV เกิดขึ้นเนื่องจากบางส่วนของ DNA มีการทำซ้ำ และจำนวนการทำซ้ำนั้นแตกต่างกันไปตามแต่ละบุคคลเนื่องจากการลบหรือการทำซ้ำของ DNA
สิ่งนี้ทำให้บางคนมีสำเนาของลำดับดีเอ็นเอเฉพาะจำนวนมาก ในขณะที่คนอื่นมีน้อยกว่ามากความผันแปรระหว่างบุคคลเหล่านี้อาจเป็นเรื่องปกติและไม่เป็นอันตราย อย่างไรก็ตาม สิ่งเหล่านี้สามารถเป็นสาเหตุของโรคได้เช่นกัน
มะเร็งสมองชนิดหนึ่งที่เรียกว่าเยื่อหุ้มสมองอักเสบ (meningioma) เป็นที่รู้จักจากความหลากหลายของ CNV ที่เกิดขึ้นระหว่างจีโนมของเนื้องอกต่างๆCNVs สามารถส่งผลต่อเมทิลเลชัน ซึ่งส่งผลต่อการแสดงออกของยีนต่อไป
ในการศึกษาโดยนักวิจัยจากมหาวิทยาลัย Northwestern University ในเมือง Evanston รัฐอิลลินอยส์ นักวิทยาศาสตร์ได้ตัดสินใจดูทั้งระดับของเมทิลเลชันในจีโนมของเยื่อหุ้มสมองอักเสบและจำนวนการทำซ้ำใน CNV ที่ต่างกันพวกเขารวมยีนบางตัวในจีโนมมะเร็งที่ควบคุมการเจริญเติบโตและการซ่อมแซมเพื่อดูว่าสิ่งนี้ให้ข้อมูลเชิงลึกเกี่ยวกับผลลัพธ์หรือไม่
ผลการวิจัยได้รับการตีพิมพ์ในวารสาร
การทำโปรไฟล์จีโนมเนื้องอกมะเร็ง
การใช้ข้อมูลจีโนมจากเนื้องอก 565 ก้อนที่นำมาจากผู้ป่วยสองกลุ่มที่ได้รับการติดตามเป็นเวลา 5-6 ปี นักวิจัยได้ระบุ DNA methylation ของจีโนมมะเร็งจากนั้นพวกเขาวิเคราะห์สิ่งนี้ควบคู่ไปกับการปรากฏตัวของ DNA ที่ทำซ้ำในบางจุดในจีโนมและยังดูที่ RNA ที่มีอยู่ในเนื้องอกเพื่อตรวจสอบว่ายีนใดมีและไม่ได้แสดงออก
พวกเขาพบว่าการดูจำนวนการทำซ้ำภายในยีนบางตัวเพียงอย่างเดียวไม่ได้ทำนายผลลัพธ์ของผู้ป่วยอย่างแม่นยำ แต่การดูจำนวนการทำซ้ำของยีนควบคู่ไปกับระดับของเมทิลเลชั่นเผยให้เห็นเนื้องอกสามระดับที่แตกต่างกัน
เพียงหนึ่งในสามของเนื้องอกในกลุ่มนี้ถูกกำหนดให้เป็นเยื่อหุ้มสมองอักเสบ "merlin intact" ซึ่งผู้ป่วยได้รับผลลัพธ์ที่ดีที่สุดเนื้องอกเหล่านี้ไม่เกี่ยวข้องกับจำนวนซ้ำที่ผิดปกติของยีนที่กำหนดรหัสสำหรับโปรตีนที่เรียกว่าเมอร์ลินซึ่ง
ในทางกลับกัน 38% มี meningiomas ที่เสริมภูมิคุ้มกันซึ่งผู้ป่วยมีผลปานกลางเนื้องอกเหล่านี้มีลักษณะเฉพาะโดยการสูญเสียยีนที่กำหนดรหัสสำหรับเมอร์ลินและการปรับลดยีนที่ยับยั้งเนื้องอกอื่น ๆ อันเนื่องมาจากเมทิลเลชัน
สิ่งนี้ทำให้พวกเขาเอาชนะการตอบสนองตามปกติจากระบบภูมิคุ้มกัน
อีก 28% มีภาวะเยื่อหุ้มสมองอักเสบจากเลือด (hypermitotic meningiomas) ซึ่งผู้ป่วยไม่เพียงแต่มีการทำซ้ำของยีนที่เข้ารหัสเมอร์ลินน้อยลงเท่านั้น แต่ยังมียีนซ้ำอีกจำนวนหนึ่งที่ทำให้การเจริญเติบโตเพิ่มขึ้นหรือการปราบปรามของเนื้องอกลดลง
พวกเขายังมีเมทิลเลชั่นที่อนุญาตให้มีการแสดงออกของยีนที่เพิ่มขึ้นซึ่งเป็นที่รู้จักเพื่อส่งเสริมการเติบโตของเซลล์ผู้ป่วยเหล่านี้มีผลลัพธ์ที่น่าพอใจน้อยที่สุด
การทดสอบยามะเร็งเต้านมในเนื้องอกในสมอง
เมื่อใช้ข้อมูลนี้ นักวิจัยได้ทดสอบยา abemaciclib ซึ่งเป็นยารักษามะเร็งที่ใช้แล้วสำหรับมะเร็งเต้านม กับเซลล์เนื้องอกในสายเซลล์ อวัยวะออร์กานอยด์ และการปลูกถ่ายเนื้อเยื่อในหนูทดลอง
ผลลัพธ์จากการทดลองเหล่านี้บ่งชี้ว่ายานี้สามารถใช้รักษาบุคคลที่ได้รับการระบุว่ามีเนื้องอกที่เสริมภูมิคุ้มกันหรือมีเนื้องอกที่เกินได้
ก่อนหน้านี้ การทดลองล้มเหลวในการระบุยาที่สามารถรักษา meningioma ได้อย่างน่าเชื่อถือ แต่การระบุ biomarker สามารถช่วยระบุผู้ป่วยที่อาจได้รับประโยชน์จากการรักษาบางอย่าง ดร.สตีเฟน มาจิล.
ดร.Magill เป็นผู้ช่วยศาสตราจารย์ด้านศัลยกรรมประสาทที่ Northwestern University Feinberg School of Medicineเขาบอกกับ Medical News Today ในการให้สัมภาษณ์ว่า "ผลการวิจัยบางส่วนของเราทำให้เกิดความเป็นไปได้มากขึ้นที่เรารู้เกี่ยวกับชีววิทยามากขึ้น [มากขึ้น] เราสามารถพูดได้ว่า: นี่ไม่ใช่แค่ meningioma แต่คุณมี hypermitotic meningioma ”
"ดังนั้นเราจึงสามารถใช้สิ่งนั้นเป็นตัวบ่งชี้ทางชีวภาพเพื่อแบ่งชั้นผู้ที่จะเข้ารับการทดลองทางคลินิกได้"
ศาสตราจารย์ Noam Shomron นักวิจัยด้านมะเร็งจากคณะแพทยศาสตร์ Sackler จากมหาวิทยาลัย Tel Aviv ประเทศอิสราเอล ซึ่งไม่ได้มีส่วนร่วมในการวิจัยดังกล่าว บอกกับ Medical News Today ว่า:
“ฉันคิดว่ามันเป็นการศึกษาที่ยอดเยี่ยม เพราะมันครอบคลุมมาก และครอบคลุมการค้นพบระดับโมเลกุลและทางคลินิก รวมถึงรูปแบบโครงสร้างและเมทิลเลชัน ซึ่งเป็นอีพีเจเนติกส์ [และบางสิ่งที่] ไม่ได้อยู่ตรงกลาง”
