Sitemap
Dela på Pinterest
Ny forskning hjälper till att identifiera bättre behandlingar för specifika typer av hjärntumörer.Vera Lair/Stocksy
  • Förbättrade vetenskapliga tekniker har gett forskarna större insikt i hur det mänskliga genomet fungerar.
  • Genom att titta på genomet och epigenomet av hjärncancertumörer har forskare nu kunnat förutsäga utfall för patienter.
  • Denna information kan också användas för att identifiera vilka behandlingar som skulle vara mest användbara för att behandla vissa cancerformer.
  • Baserat på resultaten testade forskarna bröstcancerläkemedlet abemaciclib i ett litet antal patienter och fann att deras symtom förbättrades och tumörstorleken minskade.Framtida kliniska prövningar kommer förhoppningsvis att validera dessa tidiga fynd.

Sekvensering av genomet av cancertumörer används ofta för att hjälpa till att identifiera vilken typ av cancer en person har och den bästa behandlingen för den.

Även om cancergenomik har använts i några år nu, lär sig forskare fortfarande om det bästa sättet att använda genomisk information för att gradera och kategorisera cancer.

Ett område som har fått lite uppmärksamhet hittills är cancergenomets metyleringsstatus kring specifika gener.Metyleringhänvisar till närvaron eller frånvaron av en metylgrupp på en basmolekyl i en gen som kan påverka huruvida en gen uttrycks eller inte.Denna kontroll av genetiskt uttryck kallas epigenetik.

Uttrycksnivåer av vissa gener kan också påverkas av kopienummervarianter (CNV). CNVs uppstår eftersom vissa sektioner av DNA upprepas, och antalet upprepningar varierar mellan individer på grund av deletioner eller dupliceringar av DNA.

Detta lämnar vissa människor med många kopior av en viss DNA-sekvens, medan andra har mycket färre.Dessa variationer mellan individer kan vara normala och ofarliga - men de kan också underbygga sjukdom.

En typ av hjärncancer som kallas meningiom är känd för mångfalden av CNV som förekommer mellan olika tumörers genom.CNV kan också påverka metylering, vilket ytterligare påverkar genuttrycket.

I en studie av forskare vid Northwestern University i Evanston, IL, beslutade forskarna att titta på både nivån av metylering i meningiomgenomen och antalet upprepningar i olika CNV.De inkluderade vissa gener i cancergenomet som är kända för att kontrollera tillväxt och reparation för att se om detta gav någon insikt i resultat.

Resultaten publiceras i tidskriftenNaturgenetik.

Profilering av cancertumörgenom

Med hjälp av genomiska data från 565 tumörer tagna från två kohorter av patienter som hade följts upp i 5–6 år, profilerade forskarna DNA-metyleringen av cancergenomen.De analyserade sedan detta tillsammans med närvaron av DNA-upprepningar vid vissa punkter i genomet och tittade också på RNA som fanns i tumörerna för att avgöra vilka gener som hade och inte hade uttryckts.

De fann att att titta på antalet upprepningar inom vissa gener enbart inte förutspådde patientens resultat exakt, men att titta på antalet upprepningar av gener tillsammans med nivån av metylering avslöjade tre olika grader av tumör.

Drygt en tredjedel av tumörerna i kohorten betecknades som "merlin intakta" meningiom, där patienterna hade de bästa resultaten.Dessa tumörer involverade inte onormalt antal upprepningar på genen som kodar för ett protein som kallas merlin, vilketfungerar som en tumörsuppressor. Det fanns också normal metylering runt denna gen, vilket gjorde att den kunde uttryckas normalt.

Omvänt hade 38 % immunberikade meningiom där patienterna hade mellanliggande resultat.Dessa tumörer kännetecknades av förlust av genen som kodar för merlin och nedreglering av andra tumörhämmande gener på grund av metylering.

Detta gjorde det möjligt för dem att övervinna normala svar från immunsystemet.

Ytterligare 28% hade hypermitotisk meningiom där patienten inte bara hade färre upprepningar av genen som kodar för merlin utan ett antal andra genupprepningar som orsakade antingen ökad tillväxt eller minskad tumörsuppression.

De hade också metylering som möjliggjorde ökat uttryck av en gen som är känd för att främja celltillväxt.Dessa patienter hade de minst gynnsamma resultaten.

Testar ett läkemedel mot bröstcancer i hjärntumörer

Med hjälp av denna information testade forskarna sedan läkemedlet abemaciclib, ett cancerläkemedel som redan används för bröstcancer, på tumörceller i cellinjer, organoider och xenotransplantat hos möss.

Resultat från dessa experiment indikerade att läkemedlet kunde användas för att behandla individer som hade identifierats ha antingen immunberikade tumörer eller hypermitotiska tumörer.

Tidigare försök har misslyckats med att identifiera läkemedel som på ett tillförlitligt sätt kan behandla meningiom, men identifieringen av en biomarkör kan hjälpa till att identifiera patienter som kan dra nytta av vissa behandlingar, säger huvudstudieförfattaren Dr.Stephen Magill.

Dr.Magill är biträdande professor i neurologisk kirurgi vid Northwestern University Feinberg School of Medicine.Han sa till Medical News Today i en intervju: "Några av våra fynd väcker verkligen möjligheten att ju mer vi vet om biologin, desto mer kan vi då säga: det här är inte bara ett meningiom, du har ett hypermitotiskt meningiom .”

"Så vi kan verkligen använda det som en biomarkör för att stratifiera vem som skulle gå in i en klinisk prövning."

Cancerforskare professor Noam Shomron från Sackler fakulteten för medicin från Tel Aviv University, Israel, som inte var involverad i forskningen sa till Medical News Today:

"Jag tycker att det är en underbar studie, eftersom den är så omfattande, och den spänner över molekylära och kliniska fynd och strukturella variationer och metylering - vilket är epigenetik - [och något som] inte ofta står i centrum."

Tutte le categorie: Blogg