Sitemap
Bagikan di Pinterest
Penelitian baru membantu mengidentifikasi perawatan yang lebih baik untuk jenis tumor otak tertentu.Vera Lair/Stocksy
  • Teknik ilmiah yang ditingkatkan telah memberi para peneliti wawasan yang lebih luas tentang cara kerja genom manusia.
  • Dengan melihat genom dan epigenom tumor kanker otak, para peneliti kini dapat memprediksi hasil untuk pasien.
  • Informasi ini juga dapat digunakan untuk mengidentifikasi perawatan mana yang paling berguna untuk mengobati kanker tertentu.
  • Berdasarkan temuan, para ilmuwan menguji obat kanker payudara abemaciclib pada sejumlah kecil pasien dan menemukan gejala mereka membaik dan ukuran tumor berkurang.Uji klinis di masa depan diharapkan akan memvalidasi temuan awal ini.

Pengurutan genom tumor kanker sering digunakan untuk membantu mengidentifikasi jenis kanker yang dimiliki seseorang dan pengobatan terbaik untuknya.

Meskipun genomik kanker telah digunakan selama beberapa tahun sekarang, para ilmuwan masih mempelajari cara terbaik untuk menggunakan informasi genomik untuk menilai dan mengkategorikan kanker.

Satu area yang kurang mendapat perhatian sampai sekarang adalah status metilasi genom kanker di sekitar gen tertentu.Metilasimengacu pada ada atau tidak adanya gugus metil pada molekul basa dalam gen yang dapat mempengaruhi apakah suatu gen diekspresikan atau tidak.Kontrol ekspresi genetik ini disebut sebagai epigenetik.

Tingkat ekspresi gen tertentu juga dapat dipengaruhi oleh varian jumlah salinan (CNV). CNV muncul karena beberapa bagian DNA diulang, dan jumlah pengulangan bervariasi antar individu karena penghapusan atau duplikasi DNA.

Hal ini membuat beberapa orang memiliki banyak salinan urutan DNA tertentu, sementara yang lain memiliki jauh lebih sedikit.Variasi antar individu ini bisa normal dan tidak berbahaya — namun, mereka juga dapat mendukung penyakit.

Jenis kanker otak yang disebut meningioma dikenal karena keragaman CNV yang terjadi di antara genom tumor yang berbeda.CNV juga dapat mempengaruhi metilasi, yang selanjutnya mempengaruhi ekspresi gen.

Dalam sebuah studi oleh para peneliti di Northwestern University di Evanston, IL, para ilmuwan memutuskan untuk melihat baik tingkat metilasi dalam genom meningioma dan jumlah pengulangan di CNV yang berbeda.Mereka memasukkan gen tertentu dalam genom kanker yang diketahui mengontrol pertumbuhan dan perbaikan untuk melihat apakah ini memberikan wawasan tentang hasil.

Temuan ini dipublikasikan di jurnalGenetika Alam.

Membuat profil genom tumor kanker

Menggunakan data genomik dari 565 tumor yang diambil dari dua kelompok pasien yang telah ditindaklanjuti selama 5-6 tahun, para peneliti membuat profil metilasi DNA dari genom kanker.Mereka kemudian menganalisis ini bersamaan dengan adanya pengulangan DNA pada titik-titik tertentu dalam genom dan juga melihat RNA yang ada di tumor untuk menentukan gen mana yang telah dan belum diekspresikan.

Mereka menemukan bahwa melihat jumlah pengulangan dalam gen tertentu saja tidak memprediksi hasil pasien secara akurat, tetapi melihat jumlah pengulangan gen di samping tingkat metilasi mengungkapkan tiga tingkat tumor yang berbeda.

Lebih dari sepertiga tumor dalam kohort ditetapkan sebagai meningioma "merlin utuh", di mana pasien memiliki hasil terbaik.Tumor ini tidak melibatkan jumlah pengulangan abnormal pada gen yang mengkode protein yang disebut merlin, yangbertindak sebagai penekan tumor. Ada juga metilasi normal di sekitar gen ini, yang memungkinkannya diekspresikan secara normal.

Sebaliknya, 38% memiliki meningioma yang diperkaya kekebalan di mana pasien memiliki hasil menengah.Tumor ini ditandai dengan hilangnya gen yang mengkode merlin dan penurunan regulasi gen penekan tumor lainnya karena metilasi.

Ini memungkinkan mereka untuk mengatasi respons normal dari sistem kekebalan.

Selanjutnya 28% memiliki meningioma hipermitosis di mana pasien tidak hanya memiliki lebih sedikit pengulangan gen yang mengkode merlin tetapi sejumlah pengulangan gen lain yang menyebabkan peningkatan pertumbuhan atau penurunan penekanan tumor.

Mereka juga memiliki metilasi yang memungkinkan peningkatan ekspresi gen yang dikenal untuk mendorong pertumbuhan sel.Pasien-pasien ini memiliki hasil yang paling tidak menguntungkan.

Menguji obat kanker payudara pada tumor otak

Dengan menggunakan informasi ini, para peneliti kemudian menguji obat abemaciclib, obat kanker yang sudah digunakan untuk kanker payudara, pada sel tumor dalam garis sel, organoid, dan xenograft pada tikus.

Hasil dari percobaan ini menunjukkan obat tersebut dapat digunakan untuk mengobati individu yang telah diidentifikasi memiliki tumor yang diperkaya kekebalan atau tumor hipermitosis.

Percobaan sebelumnya telah gagal untuk mengidentifikasi obat yang dapat diandalkan untuk mengobati meningioma, tetapi identifikasi biomarker dapat membantu mengidentifikasi pasien yang dapat mengambil manfaat dari perawatan tertentu, kata penulis utama studi Dr.Stephen Magill.

dr.Magill adalah asisten profesor bedah saraf di Fakultas Kedokteran Universitas Feinberg Northwestern.Dia mengatakan kepada Medical News Today dalam sebuah wawancara: “Beberapa temuan kami benar-benar meningkatkan kemungkinan bahwa semakin kita tahu tentang biologi, [semakin] kita dapat mengatakan: ini bukan hanya meningioma, Anda memiliki meningioma hipermitosis. .”

“Jadi kita benar-benar dapat menggunakannya sebagai biomarker untuk membuat stratifikasi siapa yang akan menjalani uji klinis.”

Profesor peneliti kanker Noam Shomron dari Fakultas Kedokteran Sackler dari Universitas Tel Aviv, Israel, yang tidak terlibat dalam penelitian mengatakan kepada Medical News Today:

“Saya pikir ini adalah studi yang luar biasa, karena sangat komprehensif, dan mencakup temuan molekuler dan klinis serta variasi struktural dan metilasi — yang merupakan epigenetik — [dan sesuatu yang] tidak sering menjadi pusat perhatian.”

Semua Kategori: Blog